Sau một khởi đầu chậm chạp, Hoa Kỳ đã cải thiện hệ thống giám sát của mình để theo dõi các biến thể coronavirus mới như Omicron, nâng cao năng lực của mình với hàng chục nghìn mẫu mỗi tuần kể từ đầu năm nay.
Virus không ngừng phát triển. Để tìm và theo dõi các phiên bản mới của coronavirus, các nhà khoa học phân tích cấu tạo gen của một phần mẫu thử nghiệm dương tính.
Họ tìm kiếm các ký tự hóa học trong mã di truyền của virus để tìm các biến thể mới đáng lo ngại, chẳng hạn như omicron, và theo dõi sự lây lan của các biến thể đã biết, chẳng hạn như delta.
Đó là một nỗ lực toàn cầu, nhưng cho đến gần đây Hoa Kỳ đã đóng góp rất ít. Với thử nghiệm phân tán và không phối hợp, Hoa Kỳ đã sắp xếp trình tự Ít hơn 1% các mẫu dương tính vào đầu năm nay. Giờ đây, những thử nghiệm đó được thực hiện trên 5% đến 10% mẫu. Điều này phù hợp hơn với trình tự của các quốc gia khác và Được chia sẻ với những người theo dõi bệnh toàn cầu trong suốt vụ dịch.
Kelly Wroblosky, giám đốc phụ trách các bệnh truyền nhiễm của Hiệp hội các phòng thí nghiệm sức khỏe cộng đồng cho biết: “Giám sát bộ gen rất mạnh mẽ.
Đóng góp cho nỗ lực này là khoảng 70 phòng thí nghiệm y tế công cộng của tiểu bang và địa phương, nơi sắp xếp 15.000 đến 20.000 mẫu mỗi tuần. Các phòng thí nghiệm khác, bao gồm cả các phòng thí nghiệm do Trung tâm Kiểm soát và Phòng ngừa Dịch bệnh và các nhà thầu của họ vận hành, nâng tổng số lên 40.000 đến 80.000 mỗi tuần.
9 tháng trước, khoảng 12.000 mẫu mỗi tuần được phân tích theo cách này.
Kenny Beckman của Đại học Minnesota, người đã công nhận việc phân phối đô la liên bang cho các phòng thí nghiệm công và tư cho biết: “Chúng tôi đang ở một nơi tốt hơn nhiều so với cách đây một năm hoặc thậm chí sáu hoặc chín tháng. Ông điều hành phòng thí nghiệm gen của trường đại học, hiện thu xếp khoảng 1.000 mẫu mỗi tuần từ các bang bao gồm Minnesota, Arkansas và Nam Dakota. Một năm trước, phòng thí nghiệm đã không thực hiện một trình tự.
Dựa trên 1,7 tỷ đô la trong dự luật cứu trợ coronavirus của Tổng thống Joe Biden, Hoa Kỳ đang nỗ lực tạo ra một mạng lưới quốc gia để theo dõi tốt hơn các đợt tăng đột biến của coronavirus.
Tuy nhiên, Tiến sĩ William Moss của Trường Y tế Công cộng Johns Hopkins Bloomberg cho biết khoảng hai chục quốc gia xếp hạng tỷ lệ mẫu dương tính nhiều hơn Hoa Kỳ. Sự xuất hiện của Omicron có thể “khuyến khích Hoa Kỳ làm điều đó tốt hơn”.
“Tôi nghĩ chúng ta vẫn còn một chặng đường dài phía trước,” Moss nói.
một số quốc gia được đăng nhiều kỳ Tiến sĩ Phil Vibo, giám đốc y tế của Illumina, một công ty có trụ sở tại San Diego chuyên phát triển công nghệ giải trình tự gen, lưu ý rằng chỉ có khoảng 1% các mẫu, trong khi các mẫu khác nằm trong khoảng 20%.
“Chúng tôi có thể có hệ thống hơn về điều này và nhất quán hơn, vì vậy chúng tôi đảm bảo rằng không có sa mạc nào để theo dõi di truyền, nơi chúng tôi có thể bỏ lỡ sự xuất hiện của một biến thể,” Fibo nói.
Với sự trợ giúp của các nỗ lực giám sát, các xét nghiệm PCR tiêu chuẩn sử dụng tăm bông được gửi đến các phòng thí nghiệm có thể phát hiện dấu hiệu cho thấy ai đó có thể có một biến thể omicron. Nếu xét nghiệm PCR chỉ dương tính với hai trong ba gen mục tiêu – được gọi là kết quả xét nghiệm rò rỉ S – thì đó là dấu hiệu của omicron ngay cả trước khi thực hiện thêm bước giải trình tự gen để chứng minh điều đó.
Thật may mắn, “Trevor Bedford, nhà sinh vật học và di truyền học tại Trung tâm Nghiên cứu Ung thư Fred Hutchinson, nói. “Nếu bạn cần sắp xếp thứ tự các lựa chọn thay đổi, nó sẽ luôn trễ một chút và sẽ tốn kém hơn. Nếu bạn chỉ dựa vào S-droput này làm lựa chọn, mọi việc sẽ dễ dàng hơn.”
Ông cho biết các biến khác cũng tạo ra sự sai lệch này trong kết quả kiểm tra PCR, nhưng không phải là biến delta. Bedford cho biết, với việc Delta đang thống trị Hoa Kỳ ngay bây giờ, số người bỏ học S sẽ được chú ý. (Bedford nhận được tài trợ từ Viện Y tế Howard Hughes, nơi cũng hỗ trợ Bộ Y tế và Khoa học của Associated Press.)
Tiến sĩ Anthony Fauci, chuyên gia hàng đầu về bệnh truyền nhiễm của nước này, cho biết “không đời nào” O’Micron có thể đến Mỹ.
Một số chuyên gia nhận định rằng anh ta có thể đã ở đây và sẽ sớm được hệ thống giám sát bắt. Nhưng câu hỏi đặt ra là tiếp theo là gì?
Nhà nghiên cứu bệnh AIDS David O’Connor của Đại học Wisconsin cho biết: “Chúng tôi không có những loại hạn chế đi lại giữa các tiểu bang có thể làm cho vi-rút có thể chứa virus ở bất cứ đâu.
Thay vào đó, việc giám sát di truyền sẽ cho các quan chức biết liệu omicron có đang lan truyền với tốc độ bất thường ở một nơi hay không và liệu có nên gửi thêm tài nguyên đến những nơi đó hay không, ông nói.
Khi Omicron xuất hiện, các cơ quan y tế công cộng sẽ phải xem xét các biến số khác trong nỗ lực phân loại, chẳng hạn như mức độ nhiễm trùng đã có trong cộng đồng đó và tỷ lệ tiêm chủng. Một sự bùng phát của căn bệnh nguy hiểm ở những khu vực có mật độ cao sẽ là mối quan tâm đặc biệt.
Tuy nhiên, Beckman của Đại học Minnesota nhận thấy có chút bất lợi trong việc cô đọng trình tự một cách đáng kể.
Ông nói: “Tôi không cần phải xâu chuỗi nhiều hơn một vài phần trăm các trường hợp tích cực để biết chúng đang phát triển nhanh như thế nào.
Không giống như ở một số quốc gia khác, các quan chức chính phủ Hoa Kỳ đã không thực hiện quyền bắt buộc người dân kiểm dịch nếu họ có kết quả dương tính với các biến thể đáng lo ngại. Do đó, giải trình tự chủ yếu là một công cụ giám sát để theo dõi sự lây lan của các đột biến.
Beckman nói: “Tôi nghĩ việc theo dõi các biến là rất quan trọng, nhưng tôi không nghĩ là thực tế khi nghĩ rằng chúng ta sẽ có thể trình tự nhanh chóng và trên quy mô đủ lớn để ngăn chặn một biến theo dõi của nó,” Beckman nói.
___
Các nhà văn của Associated Press Laurent Niergaard, Matthew Perrone và Ricardo Alonso Zaldivar đã đóng góp.
___
Bộ Y tế và Khoa học của Associated Press nhận được sự hỗ trợ từ Bộ phận Giáo dục Khoa học của Viện Y tế Howard Hughes. AP hoàn toàn chịu trách nhiệm về tất cả nội dung.