Việc tìm ra câu chuyện ban đầu của SARS-CoV-2, loại coronavirus gây ra gần 3,9 triệu ca tử vong trên toàn thế giới, phần lớn đã bị cản trở do thiếu khả năng tiếp cận thông tin từ Trung Quốc, nơi các ca bệnh lần đầu tiên xuất hiện.
Giờ đây, một nhà nghiên cứu ở Seattle đã phát hiện ra các tệp bị xóa khỏi Google Cloud tiết lộ 13 trình tự di truyền một phần của một số trường hợp sớm của COVID-19 ở Vũ Hán, Carl Zimmer báo cáo cho Thời báo New York.
Các trình tự không hướng quy mô về phía hoặc đi khỏi một trong nhiều giả thuyết về cách SARS-CoV-2 có thể xuất hiện – chúng không gợi ý Rò rỉ vi-rút từ một phòng thí nghiệm được bảo vệ nghiêm ngặt Ở Vũ Hán, họ không gợi ý về một sự kiện lan tỏa tự nhiên. Nhưng họ nhấn mạnh ý kiến cho rằng loại coronavirus mới này đã lây lan sớm hơn nhiều so với đợt bùng phát lớn đầu tiên trên thị trường thủy sản.
Có liên quan: 14 huyền thoại về virus Corona bị khoa học bác bỏ
Để xác định chính xác cách thức và nguồn gốc của vi rút, các nhà khoa học cần tìm ra cái gọi là vi rút tiền thân, loại vi rút mà tất cả các chủng khác có nguồn gốc từ đó. Cho đến nay, các chuỗi đầu tiên chủ yếu là những mẫu được lấy từ Chợ Hải sản Huanan ở Vũ Hán, nơi ban đầu được cho là nơi mà loại coronavirus mới xuất hiện lần đầu tiên vào cuối tháng 12 năm 2019. Tuy nhiên, các trường hợp xảy ra từ đầu tháng 12 cho đến khi Từ trước đến tháng 11 năm 2019 không có liên kết thị trường nào, cho thấy rất sớm đại dịch Virus xuất hiện từ một nơi khác.
Có một vấn đề khó chịu với những chuỗi gen đầu tiên đó. Những trường hợp được tìm thấy trên thị trường bao gồm ba đột biến bị thiếu trong các mẫu virus từ các trường hợp xuất hiện nhiều tuần ngoài thị trường. Virus thiếu ba đột biến này tương ứng với Vi-rút corona Nó được tìm thấy ở dơi móng ngựa. Các nhà khoa học tương đối chắc chắn rằng bằng cách nào đó coronavirus mới xuất hiện từ loài dơi, vì vậy có lý khi cho rằng tổ tiên cũng sẽ bỏ lỡ những đột biến này.
Giờ đây, Jesse Bloom của Viện Y tế Howard Hughes ở Seattle đã phát hiện ra rằng các trình tự bị xóa – có thể là một số mẫu đầu tiên – cũng không có đột biến đó. (Bloom là tác giả chính của một bức thư được xuất bản vào tháng 5 trên tạp chí Science kêu gọi một cuộc điều tra khách quan về nguồn gốc của coronavirus, Live Science đưa tin.)
Bloom nói với New York Times: “Nó giống với coronavirus dơi hơn ba bước so với virus ở Chợ cá Huanan. Bloom nói rằng dữ liệu mới này chỉ ra rằng virus đã lưu hành ở Vũ Hán trước khi nó xuất hiện trên thị trường thủy sản.
“Thực tế này chỉ ra rằng trình tự thị trường, là trọng tâm chính của dịch tễ học bộ gen trong Báo cáo chung của WHO-Trung Quốc التقرير … không phải đại diện cho các loại virus đang lưu hành ở Vũ Hán vào cuối tháng 12 năm 2019 và đầu tháng 1 năm 2020, Bloom đã viết trong bài báo được tải lên cơ sở dữ liệu in sẵn vào ngày 22 tháng 6. bioRxiv.
Theo Zimmer, khoảng một năm trước, 241 chuỗi gen từ bệnh nhân coronavirus đã biến mất khỏi cơ sở dữ liệu trực tuyến có tên là Sequence Read Archive do Viện Y tế Quốc gia (NIH) duy trì.
Bloom nhận thấy các trình tự bị thiếu khi anh xem một bảng tính trong một nghiên cứu được công bố vào tháng 5 năm 2020 trên tạp chí PeerJ, trong đó các tác giả đã liệt kê 241 trình tự di truyền SARS-CoV-2 tính đến cuối tháng 3 năm 2020; Các trình tự là một phần của dự án Đại học Vũ Hán có tên là PRJNA612766 và được cho là đã được tải lên kho lưu trữ đọc trình tự. Anh ấy đã tìm kiếm cơ sở dữ liệu của kho lưu trữ để tìm các trình tự và nhận được thông báo “Không tìm thấy phần tử nào”, Bloom viết trong bài báo bioRxiv, chưa được đồng nghiệp đánh giá.
Có liên quan: 11 (đôi khi) bệnh giết người lây lan qua các loài
Người gián điệp tiết lộ rằng các trình tự bị xóa đã được thu thập bởi Aisu Fu và Bệnh viện Renmin của Đại học Vũ Hán, và phiên bản nghiên cứu ban đầu được công bố về các trình tự đó (gọi tắt là Wang và cộng sự 2020) chỉ ra rằng chúng đến từ các mẫu tăm bông từ bệnh nhân ngoại trú bị nghi ngờ. Sự hiện diện của COVID-19 sớm trong vụ dịch.
Bloom không thể tìm thấy bất kỳ lời giải thích nào về lý do tại sao các trình tự bị xóa và các email mà anh gửi cho cả hai tác giả trùng khớp với cuộc điều tra đều không nhận được phản hồi.
Blum viết trên bioRxiv: “Không có lý do khoa học chính đáng cho việc xóa bỏ: các trình tự hoàn toàn phù hợp với các mẫu được mô tả trong Wang và cộng sự (2020a, b). “Không có chỉnh sửa nào đối với bài báo, bài báo nói rằng đã nhận được sự đồng ý của các đối tượng và việc giải trình tự cho thấy không có bằng chứng về việc nhiễm plasmid hoặc từ mẫu sang mẫu. Vì vậy, có vẻ như các trình tự đã được bỏ qua để che giấu sự hiện diện của chúng.”
Bloom lưu ý một số hạn chế đối với nghiên cứu của mình, chủ yếu là các trình tự chỉ là một phần và không bao gồm bất kỳ thông tin nào để cung cấp ngày tháng hoặc nơi thu thập rõ ràng – thông tin cần thiết để truy tìm nguồn gốc của virus.
Bất chấp điều đó, Bloom tin rằng việc xem xét sâu hơn dữ liệu được lưu trữ từ Viện Y tế Quốc gia và các tổ chức khác – và đặt các trình tự lại với nhau – có thể giúp vẽ ra một bức tranh rõ ràng hơn về cả nguồn gốc và sự lây lan của SARS-CoV-2 mà không cần cho các nghiên cứu thực địa ở Trung Quốc.
Đọc thêm về các chuỗi đã xóa trong Thời báo New York.
Ban đầu được xuất bản trên Live Science.